我院通過十幾年的不斷摸索和技術引進，在化工、制革、印染、制藥、造紙等工業廢水處理方面積累了許多經驗，先后完成了幾百項工程，如上海金山石化含油廢水、上海新倫紙業有限公司脫墨廢水、杭州富通公司光纖廢水、南京中山化工廠環氧丙烷廢水、上海第四制藥廠廢水處理、泰州唐仁針織品有限公司針織廢水、上海永安乳品有限公司污水處理、上海久新搪瓷廠污水處理、無錫微電子有限公司污水處理、上海楓涇酒廠污水處理、上海納鐵福傳動軸有限公司污水處理、上海金山區污水處理、上海三藥廠污水等工程，其中南京中山化工廠環氧丙烷廢水治理中采用新工藝、新菌種開拓石化廢水治理得新領域，受到聯合國環保專家的肯定。

　　在城市污水方面，該院引進消化的高密度生物膜過濾及流離球技術成功應用于蘇州河水質凈化中試項目及上海市排海工程—金山金江污水處理廠，獲得了上海市建委好評。另外該院采用改進型氧化溝、AA/AO工藝和SBR工藝，應用在南京雨花經濟開發區污水處理廠、邳州市城市污水二期工程及吳江經濟開發區遠東污水處理廠等工程，降低了投資和運行成本。